Em 1913, uma menina de quatro anos é encontrada sozinha em um navio com destino à Austrália, carregando apenas uma pequena mala e a memória de uma mulher que chamava de "Autora". Décadas depois, em 2005, Cassandra herda uma casa na Inglaterra de sua avó, Nell. Surpreendida, Cassandra descobre que a casa guarda as origens misteriosas de Nell, a mesma menina perdida no porto.

Determinada a desvendar o passado de sua avó, Cassandra embarca em uma jornada que a leva a um chalé em ruínas e a um jardim secreto, envolto em lendas locais. Ela mergulha na história da aristocrática família Mountrachet e da enigmática escritora Eliza Makepeace, cujos contos de fadas vitorianos são a única pista para o segredo.

À medida que as camadas do tempo se desdobram, Cassandra precisa conectar os fios entre Eliza, os Mountrachet e o abandono de Nell. O Jardim Secreto de Eliza é uma tapeçaria rica de segredos familiares, identidade perdida e a busca incessante pela verdade, revelando como o passado molda o presente de maneiras inesperadas e profundas.