Nas águas turbulentas do Mediterrâneo, um homem é resgatado à beira da morte, sem memória e com duas balas alojadas em seu corpo. As únicas pistas de sua identidade são um microfilme cirurgicamente implantado sob sua pele e uma série de habilidades de combate e sobrevivência que ele não consegue explicar. Quem é ele? Por que tantos querem vê-lo morto? E por que seu corpo reage com reflexos mortais a cada ameaça?

Batizado de Jason Bourne, ele se vê lançado em um labirinto mortal de intrigas internacionais. De Paris a Zurique, de Nova York a uma remota casa de campo, Bourne é caçado implacavelmente por assassinos profissionais, agentes secretos e organizações terroristas que parecem saber mais sobre ele do que ele próprio. Cada passo em sua busca pela verdade o aproxima de uma realidade chocante, onde a linha entre herói e vilão é perigosamente tênue.

Enquanto tenta desvendar os fragmentos de seu passado, Bourne descobre que está no centro de uma conspiração global que envolve a CIA, o Exército dos Estados Unidos e uma figura lendária do terrorismo internacional. Sem poder confiar em ninguém, ele precisa usar seus instintos aguçados e sua memória fragmentada para sobreviver e, finalmente, descobrir a verdade por trás da "Identidade Bourne" antes que seja tarde demais.