Linus Baker é um burocrata solitário e meticuloso que trabalha para o Departamento de Jovens Mágicos, supervisionando orfanatos para crianças com habilidades extraordinárias. Sua vida monótona e regrada é virada de cabeça para baixo quando ele é enviado para uma ilha remota, encarregado de uma missão confidencial: investigar a segurança e o bem-estar de seis crianças peculiares, cada uma com dons mágicos únicos e, por vezes, perigosos.

Neste orfanato isolado, Linus encontra um grupo de órfãos que desafia todas as suas expectativas, incluindo uma gnoma, um ser que se transforma em Pomeranian, um blob verde, um wyvern, um garoto que pode causar terremotos e, para sua surpresa, o próprio Anticristo em miniatura. Todos são supervisionados pelo enigmático e charmoso Arthur Parnassus, o diretor do orfanato, que guarda seus próprios segredos.

À medida que Linus passa mais tempo na ilha, ele é forçado a confrontar seus preconceitos e a questionar suas próprias crenças sobre o que é normal, o que é família e o que significa pertencer. Esta é uma história encantadora e profundamente comovente sobre encontrar o lar nos lugares mais inesperados e a família nas pessoas que escolhemos, celebrando a individualidade e o poder transformador da aceitação e do amor.